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Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  2.3 KB  |  50 lines
  1. ********************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 31 signatures *
  3. ********************************************
  4.  
  5. It has been shown [1,2,3] that  the  following glycosyl  hydrolases can be, on
  6. the basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Lysosomal alpha-glucosidase  (EC 3.2.1.20) (acid maltase)  is  a vertebrate
  9.    glycosidase active at low pH, which  hydrolyzes alpha(1->4) and alpha(1->6)
  10.    linkages in glycogen, maltose, and isomaltose.
  11.  - Alpha-glucosidase (EC 3.2.1.20) from the yeast Candida tsukunbaensis.
  12.  - Intestinal sucrase-isomaltase  (EC 3.2.1.48 / EC 3.2.1.10) is  a vertebrate
  13.    membrane-bound, multifunctional  enzyme  complex  which hydrolyzes sucrose,
  14.    maltose and isomaltose.  The  sucrase  and isomaltase domains of the enzyme
  15.    are homologous (41% of amino acid identity)  and have most probably evolved
  16.    by duplication.
  17.  - Glucoamylase 1 (EC 3.2.1.3)  (glucan 1,4-alpha-glucosidase)  from the yeast
  18.    Schwanniomyces occidentalis.
  19.  
  20. An aspartic acid has been implicated [4] in the catalytic activity of sucrase,
  21. isomaltase,  and lysosomal alpha-glucosidase.  The  region around  this active
  22. residue is  highly  conserved and can be used as a signature pattern.  We have
  23. used a second region, which contains two conserved cysteines, as an additional
  24. signature pattern.
  25.  
  26. -Consensus pattern: G-[LIVM]-W-x-D-M-N-E
  27.                     [D is the active site residue]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30.  
  31. -Consensus pattern: G-A-D-[LIVM]-C-G-F-x(3)-[ST]-x(3)-L-C-x-R-W-x(2)-L-G-[SA]-
  32.                     F-x-P-F-x-R-N
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  35.  
  36. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  37.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  38.  
  39. -Last update: December 1992 / Patterns and text revised.
  40.  
  41. [ 1] Henrissat B.
  42.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  43. [ 2] Kinsella B.T., Hogan S., Larkin A., Cantwell B.A.
  44.      Eur. J. Biochem. 202:657-664(1991).
  45. [ 3] Naim H.Y., Niermann T., kleinhans U., Hollenberg C.P.,
  46.      Strasser A.W.M.
  47.      FEBS Lett. 294:109-112(1991).
  48. [ 4] Hermans M.M.P., Kroos M.A., van Beeumen J., Oostra B.A., Reuser A.J.J.
  49.      J. Biol. Chem. 266:13507-13512(1991).
  50.